Neuroscience

> 令人敬畏的神经科学图书馆、软件和与该领域相关的任何内容的精选列表.

Neuroscience 是对神经系统如何发育、结构及其作用的研究. 神经科学家专注于大脑及其对行为和认知功能的影响. 传统上，神经科学一直被视为生物学的一个分支，但它已经发展成为涵盖范围广泛的跨学科领域，这些领域共同致力于在多个研究层面阐明大脑功能.

Programming

用于开发目的的软件、库和框架.

Python

• Nengo - 用于创建和模拟大规模大脑模型的库.
• Nitime - 神经科学数据的时间序列分析.
• Nilearn - 用于对 NeuroImaging 数据执行统计学习/机器学习的模块.
• DIPY - 用于分析 MR 扩散成像的工具箱.
• MNE-Python - 用于处理时间分辨神经信号的社区驱动软件，包括脑电图 (EEG) 和脑磁图 (MEG).
• NiBabel - 提供对一些常见医学和神经影像文件格式的读写访问.
• PsychoPy - 用于运行心理学和神经科学实验的软件包. 它允许在 Python 中创建心理刺激.
• NuPic - Numenta 智能计算平台是分层时间记忆 (HTM) 的实现，这是一种严格基于新皮质神经科学的智能理论.
• Brian2 - 用于尖峰神经网络的免费开源模拟器.
• expyriment - 独立于平台的轻量级 Python 库，用于设计和进行时间关键行为和神经影像学实验.
• BindsNET - 用于模拟用于强化和机器学习的尖峰神经网络的包.
• SpikeInterface - 旨在统一尖峰分类技术的框架
• NiMARE - NiMARE 是一个用于神经影像元分析的 Python 包

Matlab

• Brain Dynamics Toolbox - 用于模拟神经科学中的动力系统的开放软件.
• BrainStorm - 专门用于分析大脑记录（MEG、EEG、fNIRS、ECoG、深度电极和多单元电生理学）的开源应用程序.
• EEGLAB - 交互式 Matlab 工具箱，用于处理连续和事件相关的 EEG、MEG 和其他电生理数据.
• FieldTrip - MEG 和 EEG 分析工具箱.
• Psychtoolbox-3 - 用于视觉和神经科学研究的免费 Matlab 和 GNU Octave 函数集.
• SPM - 用于分析脑成像数据序列（fMRI、PET、SPECT、EEG、MEG）的免费开源软件.

C++

• Brayns - 可以执行神经元光线追踪渲染的简约可视化工具. 光线追踪有助于突出神经回路的区域，细胞在这些区域相互接触，以及正在形成突触的区域，从而更好地了解单个细胞以及随后的大脑功能.

JavaScript

• Brainbrowser - 库公开了一组基于网络的 3D 可视化工具，主要针对神经影像学.
• jsPsych - 用于在网络浏览器中创建和运行行为实验的库.

R

• nat: NeuroAnatomy Toolbox - 生物图像数据的（3D）可视化和分析包，尤其是单个神经元的追踪.
• brainGraph - 用于对大脑 MRI 数据进行图论分析的软件包.

Resources

与神经科学相关的有趣资源.

Ebooks

• Neuroscience Online - 深入涵盖神经科学的开放获取电子教科书和交互式课件. 由休斯顿德克萨斯大学医学院神经生物学和解剖学系提供.
• Computational Cognitive Neuroscience - 文本深入介绍了计算认知神经科学的主要思想，该领域旨在通过使用基于生物学的计算模型来理解大脑.
• Neuronal Dynamics - 涵盖计算和理论神经科学的开放式电子教科书. 由洛桑联邦理工学院 (EPFL) 提供.
• Andy's Brain Book - 预订伴侣 Andy's Brain Blog . 介绍了在 Unix 环境中工作、fMRI 分析以及常见的神经成像工具和主题.
• NiPraxis - 教科书 NiPraxis course ，涵盖了神经影像分析的基本概念，以及它们如何与更广阔的统计、工程和计算机科学领域相关联. 了解如何处理数据和代码，以更深入地了解 fMRI 方法的工作原理、它们如何失败、如何修复它们以及如何开发新方法.

Blogs

• Neuroskeptic - Discover magazine的神经科学博客，通过批判的视角审视神经科学、精神病学和心理学的最新发展.
• The Neurocritic - 通常对人脑成像、认知神经科学和精神药理学中最耸人听闻的最新发现持批评态度.
• The scicurious brain - 由维护 Scientific American, 此博客通常在单个条目中涵盖一篇研究论文.
• Action Potential - 由《自然》杂志的神经科学编辑运营的论坛.
• Andy's Brain Blog - 大量文章、教程和视频，涵盖许多流行的神经成像工具和方法.

MOOCs

Massive Open Online Courses (MOOCs) 是基于 Web 的免费远程学习计划，专为分散在各地的大量学生的参与而设计. MOOCs 可能以学院或大学课程为模式，也可能结构化程度较低.

• The Fundamentals of Neuroscience | Harvard & edX - 提供神经科学主题的介绍性调查，没有特定的先决条件，但事先接触过生物学和/或化学可能会有所帮助.
• Introduction to Neuroscience | MIT OCW - 介绍哺乳动物神经系统，重点是人脑的结构和功能.
• Computational Neuroscience | Coursera - 介绍基本的计算方法，以了解神经系统的作用和确定它们的功能.
• Medical Neuroscience - 探索人类中枢神经系统的功能组织和神经生理学，同时为理解人类行为提供神经生物学框架.
• Neuromatch Academy - 用于计算神经科学为期三周的强化暑期学校的 Jupyter 笔记本.

Communities

• Quora - Quora 上的神经科学主题包含专家对从基础到高级问题的答案.
• Reddit - 神经科学、心理学和认知科学 subreddits 列表.
• StackExchange - 心理学和神经科学 StackExchange 网站.
• neuroimaging@python.org - Python 神经影像分析讨论列表. 除其他事项外，此列表是讨论有关 NiPy 项目（包括 NiBabel、Nilearn、dipy、MNE-Python 等）.

Newsletters

• On The Brain - 哈佛马奥尼神经科学研究所的季度电子通讯.
• Comp-neuro - A mailing list that is is intended to address the broad range of research approaches and issues involved in the general field of computational neuroscience.
• BrainPost - 一个邮件列表，每周提供最新神经科学出版物的易于阅读的摘要.

Miscellaneous

• Awesome Public Datasets - Neuroscience - 高质量的开放神经科学数据集.
• McCulloch & Pitts Neural Net Simulator - 基于神经元的历史计算模型模拟器.
• ModelDB - 计算神经科学模型的可搜索数据库.
• NeuronDB - 三种神经元特性的可搜索数据库：电压门控电导、神经递质受体和神经递质物质.
• NeuroElectro - 神经元及其电生理特性的可搜索数据库（摘自文献）
• Neuroscience Mindmap - 交互式思维导图，包含为对学习神经科学感兴趣的任何人提供的精选资源.
• neuroSummerSchools - 神经科学及相关领域的暑期（和季节性）暑期学校名单.
• Brain Matters - 真正的神经科学家坐下来谈论大脑的神经科学播客.
• NeuroHackademy - 神经影像学和数据科学暑期学校，在华盛顿大学电子科学研究所举办. 讲座可通过研究所 YouTube channel.
• SORTED - 排序：有趣的科学思想和链接列表（认知/神经和数据科学）

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